Martínez Molecular Modeling Group

Institute of Chemistry and Center for Computing in Engineering and Science

University of Campinas

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Material didático

Disciplinas
  • QF531 - Físico-Química II
  • QP832/QF935 - Fundamentos Computacionais de Simulações em Química

    • Textos de Apoio e Divulgação
  • "Condutividade de Soluções Iônicas", IQ-Unicamp, 2015. Material de apoio para experimento de QF632. [PDF] [Article] [Supplementary Information]
  • "Reações Oscilantes", IQ-Unicamp, 2015. Material de apoio para experimento de QF632. [PDF] [Simulador]
  • "Cinética Química", IQ-Unicamp, 2015. Material de apoio para experimento de QF632. [PDF]
  • "Introdução à tensão superficial", IQ-Unicamp, 2012. Material de apoio para experimento sobre o tema em QF952. [PDF]
  • "Eletroquímica de equilíbrio e Teoria de Debye-Huckel", IQ-Unicamp, 2017. Texto de apoio para QF531. [PDF]
  • "The meaning of Kirkwood-Buff integrals", IQ-Unicamp, 2017. [PDF]
  • "Introdução aos métodos e desafios no cálculo da estrutura eletrônica de átomos e moléculas", IQ-Unicamp, 2001. [PDF]
  • Blog - Discussões informais que podem ser do interesse dos estudantes.
  • Blog - Tips to create beautiful publication-quality plot in Julia

    • Aulas online
  • Canal do YouTube

    • Animações
  • Resfriamento de um fluído de partículas de Lennard-Jones bidimensional, confinado em uma caixa. (mpg, 7,7Mb)
  • Simulação de um gás de Lennard-Jones bi-dimensional, com condições periódicas de contorno (mpg, 4,3Mb)

    • Cursos e Apresentações
  • "O paradoxo do enovelamento de proteínas: um modelo simples." , (vídeo) - Seminários de Extensão do IMECC-UNICAMP, produzido pelo CeMEAI, Outubro, 2016. [Apresentação (vídeo)] [slides] [artigo]
  • Material do curso "Simulación Computacional Avanzada en Química, Bioquímica y Ciencias de Materiales"
    Ministrado na Universidade de Buenos Aires, Julio de 2015. [Códigos e tutoriales, em espanhol] [PDF, código e vídeos, em espanhol]
  • Slides do Mini-curso "Campos de Força Clássicos em Simulações de Dinâmica Molecular"
    Ministrado na VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 22-26 de Agosto, 2016. LNCC - Petrópolis. [PDF, 4.2Mb]
  • Slides do Mini-curso "Introdução à Simulação por Dinâmica Molecular"
    Ministrado na V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 23-27 de Agosto, 2010. LNCC - Petrópolis. [PDF, 7.7Mb]
  • Modelagem de estruturas de proteínas usando espectrometria de massas. [LINK]
    Seminário online apresentado para o ciclo de seminários da pós-graduação da UDESC, em 2020.
  • Workshop de Modelagem Molecular em Multiescala [LINK]
    Slides e videos de várias apresentações estão disponíveis.
    Promovida pela National Science Foundation atravées do Pan-American Advanced Studies Instiute (PASI) - Instiuto Pasteur, Montevideo, 2012.
  • Slides da aula "Vida e obra dos grandes físico-químicos: Van der Waals" [PDF]

    • Mídia
  • "Software livre traz novidades nas simulações de dinâmica molecular" , Notícias do CeMEAI, Dez 2015. [link]
  • "Desarmando a 'ratoeira' hormonal." , Jornal da Unicamp - 228, 2003. [link]
  • "Estudo abre frente para produção de hormônios tireoidianos sintéticos" , Jornal da Unicamp - 449, 2009. [link]

    • Disciplinas anteriores
  • QF530 - Introdução à Química Quântica e à Espectroscopia Molecular
  • QF939/QP934 - Simulações de sistemas dinâmicos - da pandemia ao movimento molecular.
  • QF531 - Físico-Química II
  • QF637 - Introdução à Espectroscopia e à Termodinâmica Estatística
  • QF536 - Química Quântica
  • QP135 - Termodinâmica Estatística
  • QP124 - Introdução à Química Quântica e à Espectroscopia
  • QG107 - Química Geral para Biologia
  • QG104 - Química Geral (Geologia/Geografia)
  • QF632 - Laboratório de Físico-Química I
  • QP935 - Métodos de amostragem ampliada e cálculo de energia livre em simulações de dinâmica molecular.
  • QP124 - Introdução à Química Quântica e à Espectroscopia
  • QG100 - Química Geral
  • SFI5854 - Termodinâmica de Sistemas Biológicos
  • FFI0335 - Física III
  • FCM0184 - Laboratório de Física Geral III
  • FFI0180 - Laboratório de Física Geral I
  • FCM0200 - Física Básica I
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